Su creación en 1994 surge por un convenio bi institucional entre Facultad de medicina y el MSP.

El trabajo en el CENAQUE es necesariamente interdisciplinario. El equipo asistencial está constituido por médicos Intensivistas, Cirujanos Plásticos, Anestesistas, Siquiatra, apoyados por Asistente social y Fisioterapia, además de los licenciados en enfermería y enfermeros especializados en este tipo de pacientes.
Se puede afirmar que este Centro de referencia nacional está dotado de los mejores profesionales para las patologías que tratan, y de altísima especialización, además de la tecnología única en el país por su tipo y complejidad, de última generación.

Los resultados asistenciales de nuestro centro son comparables a los mejores centros especializados en quemados a nivel mundial. El promedio de internación son 7 días para el paciente de CTI y de 11 días para el paciente cuidados intermedios, con un global de las dos modalidades de 19 días. En 2016 egresaron 172 pacientes, en los últimos 10 años 1598 con una mortalidad en ese periodo de 17.5%. El 50% de los pacientes provinieron de prestadores públicos, y la otra mitad de mutualistas y seguros privados. En su gran mayoría, los pacientes tienen entre 30 y 45 años de edad.

Además de la actividad asistencial, se desarrollan actividades de docencia, investigación y extensión universitaria. En efecto, los estudiantes de posgrados de las especialidades que forman parte del equipo asistencial realizan pasantías en el CENAQUE, los estudiantes de pregrado realizan cursos de manejo inicial del paciente quemado. Se han realizado múltiples cursos de educación médica continua a lo largo de todo el país, en particular quienes trabajan en ambulancias y emergencias, médicos y enfermeros. Se realizan investigaciones que han determinado participaciones destacadas en congresos internacionales y diversas publicaciones en revistas especializadas. Las actividades de extensión universitaria involucran educación a la población en medidas de prevención de quemaduras y circunstancias que las provocan, además de manejo primario de pacientes quemados, a la espera de la asistencia médica.

Recientemente se han adquirido equipos que han sido específicamente diseñados para los pacientes que tratamos, con tecnología de vanguardia. Destacamos los ventiladores de asistencia ventilatoria mecánica con complejas prestaciones, así como monitores que permiten realizar mediciones hemodinámicas y calorimetría, vital para nuestros pacientes. Por la alteración que sufren en su metabolismo, estas medidas permiten ir adecuando los requerimientos nutricionales a lo largo de cada evolución.